Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms