Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fndc4Q3TR08 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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