Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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