Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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