Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ptchd1Q14B62 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms