Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rpusd3Q14AI6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpusd3Q14AI6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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