Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ttc21bQ0HA38 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ttc21bQ0HA38 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ttc21bQ0HA38 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ttc21bQ0HA38 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ttc21bQ0HA38 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ttc21bQ0HA38 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Ttc21bQ0HA38 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Ttc21bQ0HA38 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Ttc21bQ0HA38 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Ttc21bQ0HA38 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms