Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf541Q0GGX2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms