Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms