Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
AmbpQ07456 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms