Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cdx4Q07424 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms