Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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