Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms