Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Prrx2Q06348 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms