Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms