Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxd1Q01822 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms