Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms