Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Pde1bQ01065 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pde1bQ01065 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pde1bQ01065 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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