Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AlkP97793 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AlkP97793 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AlkP97793 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AlkP97793 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AlkP97793 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AlkP97793 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AlkP97793 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AlkP97793 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AlkP97793 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AlkP97793 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AlkP97793 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AlkP97793 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AlkP97793 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AlkP97793 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AlkP97793 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AlkP97793 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AlkP97793 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AlkP97793 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AlkP97793 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AlkP97793 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AlkP97793 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AlkP97793 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AlkP97793 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AlkP97793 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AlkP97793 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AlkP97793 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AlkP97793 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms