Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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