Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Irx2P81066 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms