Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Tp53bp1P70399 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Tp53bp1P70399 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Tp53bp1P70399 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tp53bp1P70399 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Tp53bp1P70399 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Tp53bp1P70399 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tp53bp1P70399 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Tp53bp1P70399 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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