Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeboxP70368 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms