Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbdsP70122 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms