Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp46P62069 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp46P62069 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp46P62069 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms