Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2nP61089 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms