Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csrnp3P59055 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csrnp3P59055 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms