Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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CtdsplP58465 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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CtdsplP58465 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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CtdsplP58465 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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CtdsplP58465 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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CtdsplP58465 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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CtdsplP58465 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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CtdsplP58465 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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CtdsplP58465 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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CtdsplP58465 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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CtdsplP58465 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CtdsplP58465 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms