Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms