Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms