Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NcanP55066 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcanP55066 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcanP55066 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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