Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rad23bP54728 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms