Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FmodP50608 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FmodP50608 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms