Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpbP50405 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpbP50405 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpbP50405 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpbP50405 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpbP50405 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpbP50405 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpbP50405 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SftpbP50405 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpbP50405 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpbP50405 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpbP50405 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpbP50405 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpbP50405 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SftpbP50405 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpbP50405 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpbP50405 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SftpbP50405 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SftpbP50405 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpbP50405 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpbP50405 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SftpbP50405 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SftpbP50405 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SftpbP50405 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SftpbP50405 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SftpbP50405 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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SftpbP50405 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SftpbP50405 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpbP50405 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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SftpbP50405 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpbP50405 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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