Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms