Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PtpreP49446 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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