Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VdrP48281 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
VdrP48281 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
VdrP48281 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
VdrP48281 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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VdrP48281 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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VdrP48281 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VdrP48281 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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VdrP48281 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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VdrP48281 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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VdrP48281 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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VdrP48281 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VdrP48281 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VdrP48281 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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