Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms