Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PtgfrP43117 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms