Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NodalP43021 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NodalP43021 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NodalP43021 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NodalP43021 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NodalP43021 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NodalP43021 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NodalP43021 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NodalP43021 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NodalP43021 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NodalP43021 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NodalP43021 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NodalP43021 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NodalP43021 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NodalP43021 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NodalP43021 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NodalP43021 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NodalP43021 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms