Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LifrP42703 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LifrP42703 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LifrP42703 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LifrP42703 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LifrP42703 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LifrP42703 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms