Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Mmp9P41245 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Mmp9P41245 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Mmp9P41245 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Mmp9P41245 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Mmp9P41245 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Mmp9P41245 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Mmp9P41245 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Mmp9P41245 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Mmp9P41245 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Mmp9P41245 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Mmp9P41245 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Mmp9P41245 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Mmp9P41245 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Mmp9P41245 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Mmp9P41245 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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