Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ThpoP40226 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ThpoP40226 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ThpoP40226 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ThpoP40226 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ThpoP40226 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms