Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lig1P37913 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms