Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BgnP28653 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BgnP28653 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BgnP28653 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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