Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dusp1P28563 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms