Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjc1P28229 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms