Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde6aP27664 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pde6aP27664 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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