Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pou3f1P21952 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms