Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ntf3P20181 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1780.8 ms